Le développeur principal d'Assassin's Creed Shadows assure aux joueurs que le choix d'un seul protagoniste n'aura pas d'impact significatif sur leur expérience. Le jeu présente deux personnages jouables: Naoe, une femme Shinobi, et Yasuke, un samouraï africain historique, dont l'inclusion a généré une discussion pré-libérée.
Des inquiétudes se sont présentées que se concentrer sur un personnage pourrait conduire à manquer des points de tracé cruciaux ou un gameplay. Le directeur créatif Jonathan Dumont a répondu à ces préoccupations, décrivant sa propre approche équilibrée: il joue généralement 3-5 heures avec un personnage avant de passer à l'autre pendant 2-3 heures.
Cependant, Dumont a précisé que les joueurs ne seront pas gravement désavantagés en favorisant un personnage. Alors que chaque protagoniste possède des séquences d'ouverture uniques et des scénarios personnels, le récit du jeu s'adapte au choix du joueur. Il encourage les joueurs à hiérarchiser leur caractère préféré:
"Le gameplay de base reste cohérent quel que soit votre choix.
